数据分析和可视化
数据分析是对实验的总结和研究成果的关键体现部分,是论文的核心内容。
我们的数据分析提供如下服务:
1 根据研究目标和整个实验结果对数据进行分组比较,分类判断
2 对组学数据进行关键且在一个主线上的详尽分析,发现内在的规律
3 对常规数据,包括生理、生化等数据进行分析
4 多层次数据的关联、相关分析,建立起数据之间的逻辑关系
分析的数据包括组学数据以及其他相关的数据。
数据分析的类型包括:
1 PCA分析:主成分分析,两组或者多组间的无监督分析
2 PLS-DA/(O)PLS-DA分析:偏最小二乘分析,两组或者多组间的有监督分析
3 热图和聚类分析:进行聚类分析和可视化差异物质
4 LOESS数据回归:大规模数据的模型校正
5 单变量统计分析
6 差异物质的筛选
7 多维韦恩图:组间的多维交叉分析,寻找异同
8 相关性分析和作图:不同层次数据之间的相关性分析和展示
9 模型构建和ROC曲线评价:通过机器学习进行模型构建并进行模型的ROC评价
10 化合物相互作用图:通过Cytoscape等软件进行相互作用分析
11 代谢通路图:进行化合物的代谢通路分析和作图
12 多组学联合分析:多个组学之间的相关,联合分析
可视化包括:
1 柱图
2 气泡图
3 散点图
4 折线图
5 回归图
6 得分图
7 热图
8 韦恩图
9 雨林图
10 ROC曲线图
11 相关图
12 小提琴图
13 火山图
14 箱线图
15 桑基图
16 弦图
17 网络图
18 饼图
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