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甲基化检测

甲基化,是指从活性甲基化合物上将甲基催化转移到其他化合物的过程,可形成各种甲基化合物,或是对某些蛋白质或核酸等进行化学修饰形成甲基化产物。

基因甲基化是表观遗传的最主要形式,包括DNA的甲基化和RNA的甲基化。

DNA甲基化是DNA甲基转移酶家族(Dnmts)催化一个甲基基团从s -腺苷蛋氨酸(SAM)转移到胞嘧啶残基的第五个碳上,形成5-甲基胞嘧啶(5mC)。甲基化转移酶 Dnmt3a和Dnmt3b是从头合成的Dnmts,并将甲基转移到裸露DNA上。甲基转移酶 Dnmt1是DNA甲基化的维持因子,在复制过程中维持DNA甲基化模式。当DNA进行半保留复制时,亲代DNA碱基保留原始的DNA甲基化模式。Dnmt1在复制位点结合,并通过在新形成的子链上添加甲基精确复制原始的DNA甲基化模式。5mC是最主要的DNA甲基化的形式。在基因组序列上,DNA甲基化位点有三种不同的motif类型(CG,CHG,CHH),有很多研究表明在个体内的调控机理和功能并不相同。

RNA甲基化是指在甲基转移酶的催化下,RNA的甲基腺嘌呤被选择性地添加甲基基团的化学修饰现象,主要形式为 m6A甲基化。m6A甲基化修饰是可逆化的。
RNA甲基化主要的修饰类型有两三种:一种是6-甲基腺嘌呤(m6A),是在存在于真核生物的RNA分子中最常见的和丰富的甲基化修饰和占所有RNA甲基化的80%以上。它可以被称为“第五RNA碱基”并且在调节胚胎发育和细胞命运中具有广泛的作用。另一种是5-mC,5-甲基胞嘧啶(5-mC)是一种表观遗传标记,通常也出现在各种RNA分子中。有证据表明,RNA胞嘧啶甲基化会影响各种生物学过程,例如RNA稳定性和mRNA翻译。最后一种是m1A RNA甲基化,它普遍存在于非编码RNA和mRNA中。m1A RNA甲基化功能,目前发现tRNA上发生多种m1A修饰,可能参与翻译调控。6-腺苷酸甲基化(m6A)是mRNA最常见的内部修饰之一。通俗点讲,当腺苷酸的第六位N处发生甲基化时,就是我们所说的m6A。RNA的m6A甲基化一共有大三类酶参与:甲基化转移酶(Writers),去甲基化酶(Erasers),甲基化阅读蛋白(Readers)。m6A甲基化修饰调节mRNA的剪接、翻译和稳定性,从而影响细胞的分化、增殖和凋亡。

甲基化的检测方法多种多样,以使用不同水平和不同类型的需求。我们提供如下的各种检测方式,从而全面的明确甲基化的水平和分布,弄清楚甲基化所参与的生物功能,为表观遗传学的发展提供帮助,并为下一步甲基化在癌症检测,甲基化的改变等打下基础。

以上检测我们均可以提供,测序和质谱的提供技术服务,其他方法的我们提供技术服务和检测试剂盒。

另外我们可以根据研究的需求提供甲基化和去甲基化酶、基因的检测服务。以及甲基化供体SAM: S-腺苷甲硫氨酸; 甲基化产物SAH: S-腺苷同型半胱氨酸; DNMT: DNA甲基转移酶。

注意:

1. DNA甲基化的检测需要高纯度的DNA,需要加入RNase去除RNA。

2. RNA甲基化的检测需要高纯度的RNA,需要加入DNase I去除DNA。

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